Wintersemester 2013-2014

Mastermodul I Epigenetik

Vorbesprechung Mastermodul I: 15.10.2013 14-16 Uhr, Geb.A4 3 SR

Praktikumstermine Block Epigenetik: 18.11.-29.11.2013
Vorlesung: täglich 9.15 Uhr - 10.45 Uhr, A 4.3, SR
Praktikum: täglich 11.00 Uhr - ca. 17 Uhr, A 1.5, UG
Begleitseminar: täglich 10.45 Uhr - 11.15 Uhr
Abschlussseminar: 29.11.2013
Klausur: 06.12.2013, HS Geb. 45
Prüfung(en): 10191, 10192

Vorlesung

Mo pdf 01 - Introduction and overview 18.11 Walter
Di pdf 02 - Chromatin modifications and chromatin analysis 19.11 Walter
Mi pdf 03 - DNA-methylation and DNA-methylation analysis 20.11 Walter
Do pdf 04 - Epigenetics and development 21.11 Walter
Fr pdf 05 - Epigenetics and cancer 22.12 Walter
Mo pdf 06 - RNA interference and epigenetic regulation 25.12 Simon
Di pdf 07 - Epigenomics 26.12 Walter
Mi pdf 08 - Environement and epigenetic inheritance 27.12 Paulsen
Do pdf 09 - Summary and questions 28.12 Walter


Praktikumsskript

pdf Praktikumsskript


BiQAnalyzer HT Installer für Windows

zip BiQAnalyzer HT Installer


BiQAnalyzer HT Referenzsequenzen (Backup)

[txt] LINE1

[txt] HERVK

[txt] CCND2

[txt] CDKN1A

[txt] TP53

[txt] SYK


doc genomische und Bisulfit-Sequenzen Backup-Amplikons


Excel-Dateien für die 450K-Auswertung

[xls] CCND2

[xls] CDKN1A

[xls] SYK

[xls] TP53


tdf-Dateien zum Hochladen in den IGV-Browser

[tdf] Methylierung_hg19

[tdf] Expression_hg18



ImageJ Installer

[exe] Image J Version 143

[exe] Image J Version 142



Folien Vorbesprechungen

pdf Einführung


pdf Auswertung 450K und Primerdesign


[pptx] MiSeq+BiQAnalyzerHT


Gelbilder

zip Gelbilder


Sequenzierungsergebnisse

zip Reads_fasta


zip Pattern Maps


Abschlußbesprechung

[xlsx] Expressionsdaten


[xlsx] Methylierungsdaten


doc RT-PCR Primersequenzen


[pptx] Abschlussbesprechung